Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC35F1Q5T1Q4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC35F1Q5T1Q4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC35F1Q5T1Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC35F1Q5T1Q4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC35F1Q5T1Q4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F1Q5T1Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35F1Q5T1Q4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms