Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PITRM1Q5JRX3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PITRM1Q5JRX3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PITRM1Q5JRX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PITRM1Q5JRX3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PITRM1Q5JRX3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PITRM1Q5JRX3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PITRM1Q5JRX3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms