Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCM7

TUBB8, Tubulin beta-8 chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB8Q3ZCM7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TUBB8Q3ZCM7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TUBB8Q3ZCM7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TUBB8Q3ZCM7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TUBB8Q3ZCM7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TUBB8Q3ZCM7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TUBB8Q3ZCM7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB8Q3ZCM7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB8Q3ZCM7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TUBB8Q3ZCM7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB8Q3ZCM7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TUBB8Q3ZCM7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TUBB8Q3ZCM7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms