Protein–RNA interactions for Protein: Q38SD2

LRRK1, Leucine-rich repeat serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRK1Q38SD2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRK1Q38SD2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRK1Q38SD2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRK1Q38SD2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRK1Q38SD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
LRRK1Q38SD2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRK1Q38SD2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms