Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CSPP1Q1MSJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CSPP1Q1MSJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CSPP1Q1MSJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CSPP1Q1MSJ5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CSPP1Q1MSJ5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
CSPP1Q1MSJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms