Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GEN1Q17RS7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GEN1Q17RS7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GEN1Q17RS7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GEN1Q17RS7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GEN1Q17RS7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GEN1Q17RS7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
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