Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLPPQ16740 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CLPPQ16740 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLPPQ16740 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLPPQ16740 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLPPQ16740 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLPPQ16740 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms