Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PDK4Q16654 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PDK4Q16654 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PDK4Q16654 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PDK4Q16654 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PDK4Q16654 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PDK4Q16654 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDK4Q16654 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
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