Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP6AP1Q15904 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP6AP1Q15904 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP6AP1Q15904 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP6AP1Q15904 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP6AP1Q15904 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATP6AP1Q15904 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
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