Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VAMP3Q15836 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAMP3Q15836 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAMP3Q15836 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAMP3Q15836 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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