Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CHRNA6Q15825 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHRNA6Q15825 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHRNA6Q15825 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHRNA6Q15825 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHRNA6Q15825 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHRNA6Q15825 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
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