Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18Q15532 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18Q15532 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18Q15532 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SS18Q15532 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SS18Q15532 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SS18Q15532 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SS18Q15532 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18Q15532 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18Q15532 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18Q15532 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18Q15532 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SS18Q15532 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SS18Q15532 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SS18Q15532 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SS18Q15532 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SS18Q15532 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SS18Q15532 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SS18Q15532 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SS18Q15532 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SS18Q15532 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SS18Q15532 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SS18Q15532 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SS18Q15532 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SS18Q15532 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SS18Q15532 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SS18Q15532 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SS18Q15532 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SS18Q15532 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SS18Q15532 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SS18Q15532 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SS18Q15532 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SS18Q15532 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SS18Q15532 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SS18Q15532 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SS18Q15532 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SS18Q15532 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SS18Q15532 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SS18Q15532 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18Q15532 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18Q15532 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18Q15532 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18Q15532 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SS18Q15532 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SS18Q15532 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SS18Q15532 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SS18Q15532 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SS18Q15532 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SS18Q15532 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SS18Q15532 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18Q15532 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18Q15532 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18Q15532 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18Q15532 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18Q15532 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SS18Q15532 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SS18Q15532 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SS18Q15532 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SS18Q15532 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SS18Q15532 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SS18Q15532 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18Q15532 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18Q15532 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18Q15532 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18Q15532 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SS18Q15532 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18Q15532 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SS18Q15532 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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