Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
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SNX17Q15036 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
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SNX17Q15036 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNX17Q15036 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
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SNX17Q15036 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
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SNX17Q15036 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNX17Q15036 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNX17Q15036 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
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SNX17Q15036 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
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SNX17Q15036 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX17Q15036 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SNX17Q15036 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
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SNX17Q15036 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
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SNX17Q15036 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SNX17Q15036 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SNX17Q15036 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
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