Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GINS1Q14691 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GINS1Q14691 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GINS1Q14691 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GINS1Q14691 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINS1Q14691 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GINS1Q14691 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GINS1Q14691 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS1Q14691 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS1Q14691 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GINS1Q14691 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GINS1Q14691 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms