Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM53BQ14153 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FAM53BQ14153 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM53BQ14153 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM53BQ14153 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM53BQ14153 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM53BQ14153 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms