Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
COL9A3Q14050 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
COL9A3Q14050 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
COL9A3Q14050 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
COL9A3Q14050 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
COL9A3Q14050 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
COL9A3Q14050 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
COL9A3Q14050 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
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