Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RUNX3Q13761 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RUNX3Q13761 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RUNX3Q13761 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RUNX3Q13761 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
RUNX3Q13761 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RUNX3Q13761 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RUNX3Q13761 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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