Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 66.5
PABPC4Q13310 SLC25A4-202ENST00000491736 1666 ntTSL 524.89■■□□□ 1.582e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.382e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 C1QBP-202ENST00000570805 688 ntTSL 312.31□□□□□ -0.442e-15■■■■■ 66.4
PABPC4Q13310 CUX1-204ENST00000393824 2331 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.53e-25■■■■■ 66.3
PABPC4Q13310 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.712e-14■■■■■ 66.2
PABPC4Q13310 CLPP-205ENST00000596605 646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.072e-14■■■■■ 66.2
PABPC4Q13310 ACTR6-213ENST00000553038 2045 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-201ENST00000188312 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.884e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-202ENST00000546902 1877 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.894e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-204ENST00000548180 1747 ntTSL 28.22□□□□□ -1.094e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.764e-8■■■■■ 66.1
PABPC4Q13310 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.161e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.811e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 SWI5-202ENST00000372898 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.03■□□□□ 0.321e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 SWI5-203ENST00000418976 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 65.5
PABPC4Q13310 COPS4-202ENST00000503682 1702 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 COPS4-206ENST00000509093 2273 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 COPS4-201ENST00000264389 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.924e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 COPS4-209ENST00000511653 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 65.4
PABPC4Q13310 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.469e-8■■■■■ 65.3
PABPC4Q13310 TMED1-202ENST00000586835 713 ntTSL 216.1■□□□□ 0.179e-8■■■■■ 65.3
PABPC4Q13310 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.523e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.1-203ENST00000417221 508 ntTSL 416.8■□□□□ 0.283e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.1-201ENST00000556904 563 ntTSL 414.46□□□□□ -0.093e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.1-202ENST00000557804 2159 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.453e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5.52□□□□□ -1.533e-8■■■■■ 65.2
PABPC4Q13310 PABPC1-217ENST00000521067 492 ntTSL 324.79■■□□□ 1.561e-323■■■■■ 64.9
PABPC4Q13310 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.531e-323■■■■■ 64.6
PABPC4Q13310 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.047e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.227e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-208ENST00000471185 598 ntTSL 1 (best)20.38■□□□□ 0.857e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.347e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC8.49□□□□□ -1.057e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 NFU1-209ENST00000474230 666 ntTSL 37.44□□□□□ -1.227e-18■■■■■ 64.3
PABPC4Q13310 PRKCH-216ENST00000555542 521 ntTSL 429.61■■■□□ 2.332e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.882e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-213ENST00000444226 701 ntTSL 326.28■■□□□ 1.82e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.582e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-205ENST00000485896 1429 ntTSL 224.79■■□□□ 1.562e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-219ENST00000555906 459 ntTSL 324.1■■□□□ 1.452e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-203ENST00000469781 2256 ntTSL 223.2■■□□□ 1.32e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-220ENST00000497932 1495 ntTSL 1 (best)22.83■■□□□ 1.252e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 TRIM56-202ENST00000412507 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)22.58■■□□□ 1.212e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-217ENST00000483937 1603 ntTSL 222.28■■□□□ 1.162e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.12e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.812e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-208ENST00000636461 5083 ntTSL 519.96■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-212ENST00000574985 2318 ntTSL 219.7■□□□□ 0.742e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-202ENST00000344592 2565 ntTSL 1 (best)18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.612e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-214ENST00000575679 757 ntTSL 318.68■□□□□ 0.582e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.462e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-203ENST00000423832 2040 ntTSL 517.77■□□□□ 0.432e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-206ENST00000561633 603 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-207ENST00000553831 545 ntTSL 417.04■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-207ENST00000561721 637 ntTSL 216.41■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-206ENST00000553830 514 ntTSL 516.27■□□□□ 0.22e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-209ENST00000564509 806 ntTSL 1 (best)15.43■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 C1orf35-204ENST00000472617 3554 ntTSL 215.31■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-218ENST00000496063 892 ntTSL 315.25■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.032e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SNHG20-203ENST00000565256 1234 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 CDK5-205ENST00000487703 922 ntTSL 515.07■□□□□ 02e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-211ENST00000569632 377 ntTSL 1 (best)14.46□□□□□ -0.092e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-208ENST00000615713 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-206ENST00000637088 6740 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-224ENST00000589827 1791 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-201ENST00000638115 4453 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-202ENST00000430767 5283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-205ENST00000638079 3146 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 NICN1-207ENST00000497742 1743 ntTSL 512.85□□□□□ -0.352e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 AC104452.1-207ENST00000638014 4510 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-226ENST00000557585 938 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 FLYWCH1-205ENST00000570752 3721 ntTSL 212.16□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-201ENST00000392476 2957 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.532e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 RPS28P7-201ENST00000473748 210 ntBASIC11.66□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 MAPKAP1-209ENST00000420643 984 ntTSL 511.48□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-213ENST00000555185 582 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-211ENST00000555082 2932 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 ADAM10-201ENST00000260408 11431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.682e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-222ENST00000556778 545 ntTSL 410.38□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 RNASEH2B-205ENST00000495244 971 ntTSL 58.69□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-205ENST00000553726 545 ntTSL 58.54□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-204ENST00000553265 552 ntTSL 47.95□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 RNASEH2B-207ENST00000613449 3328 ntTSL 27.85□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PRKCH-220ENST00000556164 429 ntTSL 37.2□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 SEC14L1-208ENST00000564414 528 ntTSL 1 (best)7.04□□□□□ -1.282e-7■■■■■ 64.2
PABPC4Q13310 PIP5K1B-207ENST00000478500 3335 ntTSL 1 (best)6.04□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 64.2
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