RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281456.10

SLC25A4-201, Transcript of solute carrier family 25 member 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A4, Length 4,440 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4-201ENST00000281456 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.63■■■□□ 2.49
SLC25A4-201ENST00000281456 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.72■■■□□ 2.19
SLC25A4-201ENST00000281456 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.49■■□□□ 1.99
SLC25A4-201ENST00000281456 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCC9O60706 1549 aa26■■□□□ 1.75
SLC25A4-201ENST00000281456 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.67■■□□□ 1.7
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa25.63■■□□□ 1.69
SLC25A4-201ENST00000281456 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SLC25A4-201ENST00000281456 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
SLC25A4-201ENST00000281456 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.32■■□□□ 1.64
SLC25A4-201ENST00000281456 TRIM41Q8WV44 630 aa25.28■■□□□ 1.64
SLC25A4-201ENST00000281456 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.98■■□□□ 1.59
SLC25A4-201ENST00000281456 SCRIBQ14160 1630 aa24.95■■□□□ 1.59
SLC25A4-201ENST00000281456 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
SLC25A4-201ENST00000281456 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.54
SLC25A4-201ENST00000281456 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SLC25A4-201ENST00000281456 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.62■■□□□ 1.53
SLC25A4-201ENST00000281456 APLP2Q06481 763 aa24.61■■□□□ 1.53
SLC25A4-201ENST00000281456 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.59■■□□□ 1.53
SLC25A4-201ENST00000281456 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa24.57■■□□□ 1.52
SLC25A4-201ENST00000281456 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.56■■□□□ 1.52
SLC25A4-201ENST00000281456 NACADO15069 1562 aa24.55■■□□□ 1.52
SLC25A4-201ENST00000281456 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
SLC25A4-201ENST00000281456 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
SLC25A4-201ENST00000281456 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SLC25A4-201ENST00000281456 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.1■■□□□ 1.45
SLC25A4-201ENST00000281456 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.02■■□□□ 1.44
SLC25A4-201ENST00000281456 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
SLC25A4-201ENST00000281456 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
SLC25A4-201ENST00000281456 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.4
SLC25A4-201ENST00000281456 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.79■■□□□ 1.4
SLC25A4-201ENST00000281456 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.78■■□□□ 1.4
SLC25A4-201ENST00000281456 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
SLC25A4-201ENST00000281456 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SLC25A4-201ENST00000281456 ITGAEP38570 1179 aa23.57■■□□□ 1.36
SLC25A4-201ENST00000281456 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SLC25A4-201ENST00000281456 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SLC25A4-201ENST00000281456 HRCP23327 699 aa23.52■■□□□ 1.36
SLC25A4-201ENST00000281456 WIZO95785 1651 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A4-201ENST00000281456 FBLN2P98095 1184 aa23.44■■□□□ 1.34
SLC25A4-201ENST00000281456 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
SLC25A4-201ENST00000281456 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.4■■□□□ 1.34
SLC25A4-201ENST00000281456 P3H3Q8IVL6 736 aa23.39■■□□□ 1.33
SLC25A4-201ENST00000281456 SMARCA2P51531 1590 aa23.27■■□□□ 1.32
SLC25A4-201ENST00000281456 SMARCA4P51532 1647 aa23.26■■□□□ 1.31
SLC25A4-201ENST00000281456 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.23■■□□□ 1.31
SLC25A4-201ENST00000281456 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
SLC25A4-201ENST00000281456 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
SLC25A4-201ENST00000281456 ABCC8Q09428 1581 aa23.14■■□□□ 1.29
SLC25A4-201ENST00000281456 ARID3CA6NKF2 412 aa23.13■■□□□ 1.29
SLC25A4-201ENST00000281456 EEA1Q15075 1411 aa23.11■■□□□ 1.29
SLC25A4-201ENST00000281456 SOGA1O94964 1423 aa23.09■■□□□ 1.29
SLC25A4-201ENST00000281456 KIF27Q86VH2 1401 aa23.01■■□□□ 1.27
SLC25A4-201ENST00000281456 CLIP1P30622 1438 aa23■■□□□ 1.27
SLC25A4-201ENST00000281456 GOLGA3Q08378 1498 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC25A4-201ENST00000281456 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.98■■□□□ 1.27
SLC25A4-201ENST00000281456 CEP162Q5TB80 1403 aa22.97■■□□□ 1.27
SLC25A4-201ENST00000281456 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.91■■□□□ 1.26
SLC25A4-201ENST00000281456 TNIKQ9UKE5 1360 aa22.89■■□□□ 1.26
SLC25A4-201ENST00000281456 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.88■■□□□ 1.25
SLC25A4-201ENST00000281456 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SLC25A4-201ENST00000281456 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SLC25A4-201ENST00000281456 CUX2O14529 1486 aa22.84■■□□□ 1.25
SLC25A4-201ENST00000281456 BICRAQ9NZM4 1560 aa22.82■■□□□ 1.24
SLC25A4-201ENST00000281456 ERCC6Q03468 1493 aa22.81■■□□□ 1.24
SLC25A4-201ENST00000281456 NCAPD3P42695 1498 aa22.79■■□□□ 1.24
SLC25A4-201ENST00000281456 TRIM52Q96A61 297 aa22.77■■□□□ 1.24
SLC25A4-201ENST00000281456 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.76■■□□□ 1.23
SLC25A4-201ENST00000281456 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.73■■□□□ 1.23
SLC25A4-201ENST00000281456 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
SLC25A4-201ENST00000281456 NEUROD1Q13562 356 aa22.71■■□□□ 1.23
SLC25A4-201ENST00000281456 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC25A4-201ENST00000281456 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SLC25A4-201ENST00000281456 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.67■■□□□ 1.22
SLC25A4-201ENST00000281456 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SLC25A4-201ENST00000281456 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SLC25A4-201ENST00000281456 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC25A4-201ENST00000281456 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.59■■□□□ 1.21
SLC25A4-201ENST00000281456 UNC13AQ9UPW8 1703 aa22.55■■□□□ 1.2
SLC25A4-201ENST00000281456 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.53■■□□□ 1.2
SLC25A4-201ENST00000281456 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SLC25A4-201ENST00000281456 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.49■■□□□ 1.19
SLC25A4-201ENST00000281456 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.48■■□□□ 1.19
SLC25A4-201ENST00000281456 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa22.47■■□□□ 1.19
SLC25A4-201ENST00000281456 CFTRP13569 1480 aa22.42■■□□□ 1.18
SLC25A4-201ENST00000281456 DNAJC5BQ9UF47 199 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC25A4-201ENST00000281456 HMGXB3Q12766 1538 aa22.41■■□□□ 1.18
SLC25A4-201ENST00000281456 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.39■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 NESP48681 1621 aa22.37■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.36■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.34■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SLC25A4-201ENST00000281456 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC25A4-201ENST00000281456 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.32■■□□□ 1.16
SLC25A4-201ENST00000281456 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.31■■□□□ 1.16
SLC25A4-201ENST00000281456 IGF1RP08069 1367 aa22.3■■□□□ 1.16
SLC25A4-201ENST00000281456 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SLC25A4-201ENST00000281456 SYNJ1O43426 1573 aa22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.6 ms