RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423832.5

NICN1-203, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 5

Gene NICN1, Length 2,040 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-203ENST00000423832 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.14■■■■□ 3.38
NICN1-203ENST00000423832 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.04■■■□□ 2.72
NICN1-203ENST00000423832 ABCC9O60706 1549 aa31.42■■■□□ 2.62
NICN1-203ENST00000423832 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.37■■■□□ 2.45
NICN1-203ENST00000423832 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.15■■■□□ 2.42
NICN1-203ENST00000423832 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
NICN1-203ENST00000423832 NACADO15069 1562 aa30.11■■■□□ 2.41
NICN1-203ENST00000423832 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.89■■■□□ 2.38
NICN1-203ENST00000423832 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.82■■■□□ 2.36
NICN1-203ENST00000423832 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.52■■■□□ 2.32
NICN1-203ENST00000423832 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.42■■■□□ 2.3
NICN1-203ENST00000423832 SCRIBQ14160 1630 aa29.37■■■□□ 2.29
NICN1-203ENST00000423832 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.26■■■□□ 2.27
NICN1-203ENST00000423832 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.82■■■□□ 2.2
NICN1-203ENST00000423832 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.77■■■□□ 2.2
NICN1-203ENST00000423832 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
NICN1-203ENST00000423832 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.37■■■□□ 2.13
NICN1-203ENST00000423832 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.21■■■□□ 2.11
NICN1-203ENST00000423832 SMARCA4P51532 1647 aa28.04■■■□□ 2.08
NICN1-203ENST00000423832 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28■■■□□ 2.07
NICN1-203ENST00000423832 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.91■■■□□ 2.06
NICN1-203ENST00000423832 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.86■■■□□ 2.05
NICN1-203ENST00000423832 SMARCA2P51531 1590 aa27.8■■■□□ 2.04
NICN1-203ENST00000423832 NCAPD3P42695 1498 aa27.8■■■□□ 2.04
NICN1-203ENST00000423832 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.69■■■□□ 2.02
NICN1-203ENST00000423832 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
NICN1-203ENST00000423832 HMGXB3Q12766 1538 aa27.65■■■□□ 2.02
NICN1-203ENST00000423832 WIZO95785 1651 aa27.63■■■□□ 2.01
NICN1-203ENST00000423832 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
NICN1-203ENST00000423832 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
NICN1-203ENST00000423832 NESP48681 1621 aa27.22■■□□□ 1.95
NICN1-203ENST00000423832 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
NICN1-203ENST00000423832 ERCC6Q03468 1493 aa27.06■■□□□ 1.92
NICN1-203ENST00000423832 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.05■■□□□ 1.92
NICN1-203ENST00000423832 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.03■■□□□ 1.92
NICN1-203ENST00000423832 CCDC88BA6NC98 1476 aa27■■□□□ 1.91
NICN1-203ENST00000423832 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.89■■□□□ 1.9
NICN1-203ENST00000423832 CFTRP13569 1480 aa26.87■■□□□ 1.89
NICN1-203ENST00000423832 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.87■■□□□ 1.89
NICN1-203ENST00000423832 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.74■■□□□ 1.87
NICN1-203ENST00000423832 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.87
NICN1-203ENST00000423832 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.69■■□□□ 1.86
NICN1-203ENST00000423832 PRDM2Q13029 1718 aa26.66■■□□□ 1.86
NICN1-203ENST00000423832 CUX2O14529 1486 aa26.63■■□□□ 1.85
NICN1-203ENST00000423832 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.61■■□□□ 1.85
NICN1-203ENST00000423832 WDR62O43379 1518 aa26.5■■□□□ 1.83
NICN1-203ENST00000423832 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NICN1-203ENST00000423832 TOPBP1Q92547 1522 aa26.32■■□□□ 1.8
NICN1-203ENST00000423832 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.26■■□□□ 1.8
NICN1-203ENST00000423832 ABCC8Q09428 1581 aa26.25■■□□□ 1.79
NICN1-203ENST00000423832 CUX1P39880 1505 aa26.17■■□□□ 1.78
NICN1-203ENST00000423832 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
NICN1-203ENST00000423832 IFT140Q96RY7 1462 aa26.1■■□□□ 1.77
NICN1-203ENST00000423832 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.07■■□□□ 1.76
NICN1-203ENST00000423832 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
NICN1-203ENST00000423832 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.04■■□□□ 1.76
NICN1-203ENST00000423832 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.76
NICN1-203ENST00000423832 SOGA1O94964 1423 aa26.02■■□□□ 1.76
NICN1-203ENST00000423832 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
NICN1-203ENST00000423832 SYNJ1O43426 1573 aa25.98■■□□□ 1.75
NICN1-203ENST00000423832 TOP2BQ02880 1626 aa25.93■■□□□ 1.74
NICN1-203ENST00000423832 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.743e-7■■■□□ 17
NICN1-203ENST00000423832 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NICN1-203ENST00000423832 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.92■■□□□ 1.74
NICN1-203ENST00000423832 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
NICN1-203ENST00000423832 WDR97A6NE52 1622 aa25.8■■□□□ 1.72
NICN1-203ENST00000423832 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.77■■□□□ 1.72
NICN1-203ENST00000423832 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.77■■□□□ 1.72
NICN1-203ENST00000423832 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.71■■□□□ 1.71
NICN1-203ENST00000423832 FBLN2P98095 1184 aa25.67■■□□□ 1.7
NICN1-203ENST00000423832 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.67■■□□□ 1.7
NICN1-203ENST00000423832 GRIN2BQ13224 1484 aa25.66■■□□□ 1.7
NICN1-203ENST00000423832 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.66■■□□□ 1.7
NICN1-203ENST00000423832 PBRM1Q86U86 1689 aa25.64■■□□□ 1.7
NICN1-203ENST00000423832 OSCARQ8IYS5 282 aa25.63■■□□□ 1.69
NICN1-203ENST00000423832 CHD1O14646 1710 aa25.59■■□□□ 1.69
NICN1-203ENST00000423832 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
NICN1-203ENST00000423832 TRIM41Q8WV44 630 aa25.55■■□□□ 1.68
NICN1-203ENST00000423832 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
NICN1-203ENST00000423832 SYNJ2O15056 1496 aa25.49■■□□□ 1.67
NICN1-203ENST00000423832 KIF27Q86VH2 1401 aa25.46■■□□□ 1.67
NICN1-203ENST00000423832 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.46■■□□□ 1.67
NICN1-203ENST00000423832 ADAMTS12P58397 1594 aa25.42■■□□□ 1.66
NICN1-203ENST00000423832 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.38■■□□□ 1.65
NICN1-203ENST00000423832 IGF1RP08069 1367 aa25.36■■□□□ 1.65
NICN1-203ENST00000423832 GRIN2AQ12879 1464 aa25.35■■□□□ 1.65
NICN1-203ENST00000423832 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.34■■□□□ 1.65
NICN1-203ENST00000423832 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.29■■□□□ 1.64
NICN1-203ENST00000423832 CUL7Q14999 1698 aa25.25■■□□□ 1.63
NICN1-203ENST00000423832 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.25■■□□□ 1.63
NICN1-203ENST00000423832 CEP170Q5SW79 1584 aa25.24■■□□□ 1.63
NICN1-203ENST00000423832 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.22■■□□□ 1.63
NICN1-203ENST00000423832 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.2■■□□□ 1.62
NICN1-203ENST00000423832 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.2■■□□□ 1.62
NICN1-203ENST00000423832 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.2■■□□□ 1.62
NICN1-203ENST00000423832 ARHGEF11O15085 1522 aa25.2■■□□□ 1.62
NICN1-203ENST00000423832 NUP160Q12769 1436 aa25.19■■□□□ 1.62
NICN1-203ENST00000423832 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NICN1-203ENST00000423832 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.06■■□□□ 1.6
NICN1-203ENST00000423832 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.05■■□□□ 1.6
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