RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000214869.6

TMED1-201, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMED1, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED1-201ENST00000214869 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.58■■■■□ 3.45
TMED1-201ENST00000214869 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.18■■■□□ 2.74
TMED1-201ENST00000214869 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.67■■■□□ 2.5
TMED1-201ENST00000214869 ABCC9O60706 1549 aa30.46■■■□□ 2.47
TMED1-201ENST00000214869 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.38■■■□□ 2.45
TMED1-201ENST00000214869 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.17■■■□□ 2.42
TMED1-201ENST00000214869 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30■■■□□ 2.39
TMED1-201ENST00000214869 NACADO15069 1562 aa30■■■□□ 2.39
TMED1-201ENST00000214869 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.78■■■□□ 2.36
TMED1-201ENST00000214869 SCRIBQ14160 1630 aa29.32■■■□□ 2.28
TMED1-201ENST00000214869 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.31■■■□□ 2.28
TMED1-201ENST00000214869 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.2■■■□□ 2.26
TMED1-201ENST00000214869 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.88■■■□□ 2.21
TMED1-201ENST00000214869 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.58■■■□□ 2.17
TMED1-201ENST00000214869 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.36■■■□□ 2.13
TMED1-201ENST00000214869 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TMED1-201ENST00000214869 SMARCA4P51532 1647 aa28.2■■■□□ 2.1
TMED1-201ENST00000214869 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TMED1-201ENST00000214869 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.19■■■□□ 2.1
TMED1-201ENST00000214869 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.13■■■□□ 2.09
TMED1-201ENST00000214869 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TMED1-201ENST00000214869 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TMED1-201ENST00000214869 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.95■■■□□ 2.06
TMED1-201ENST00000214869 WIZO95785 1651 aa27.94■■■□□ 2.06
TMED1-201ENST00000214869 SMARCA2P51531 1590 aa27.82■■■□□ 2.04
TMED1-201ENST00000214869 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.79■■■□□ 2.04
TMED1-201ENST00000214869 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
TMED1-201ENST00000214869 NCAPD3P42695 1498 aa27.66■■■□□ 2.02
TMED1-201ENST00000214869 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.66■■■□□ 2.02
TMED1-201ENST00000214869 HMGXB3Q12766 1538 aa27.62■■■□□ 2.01
TMED1-201ENST00000214869 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
TMED1-201ENST00000214869 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.36■■□□□ 1.97
TMED1-201ENST00000214869 CFTRP13569 1480 aa26.93■■□□□ 1.9
TMED1-201ENST00000214869 PRDM2Q13029 1718 aa26.88■■□□□ 1.89
TMED1-201ENST00000214869 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.87■■□□□ 1.89
TMED1-201ENST00000214869 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.81■■□□□ 1.88
TMED1-201ENST00000214869 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.78■■□□□ 1.88
TMED1-201ENST00000214869 NESP48681 1621 aa26.65■■□□□ 1.86
TMED1-201ENST00000214869 ABCC8Q09428 1581 aa26.6■■□□□ 1.85
TMED1-201ENST00000214869 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.54■■□□□ 1.84
TMED1-201ENST00000214869 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.54■■□□□ 1.84
TMED1-201ENST00000214869 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.53■■□□□ 1.84
TMED1-201ENST00000214869 TRIM41Q8WV44 630 aa26.49■■□□□ 1.83
TMED1-201ENST00000214869 SYNJ1O43426 1573 aa26.45■■□□□ 1.83
TMED1-201ENST00000214869 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.45■■□□□ 1.82
TMED1-201ENST00000214869 TOP2BQ02880 1626 aa26.44■■□□□ 1.82
TMED1-201ENST00000214869 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.43■■□□□ 1.82
TMED1-201ENST00000214869 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.43■■□□□ 1.82
TMED1-201ENST00000214869 CUX1P39880 1505 aa26.4■■□□□ 1.82
TMED1-201ENST00000214869 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.31■■□□□ 1.8
TMED1-201ENST00000214869 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
TMED1-201ENST00000214869 TOPBP1Q92547 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
TMED1-201ENST00000214869 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.21■■□□□ 1.79
TMED1-201ENST00000214869 ERCC6Q03468 1493 aa26.16■■□□□ 1.78
TMED1-201ENST00000214869 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.13■■□□□ 1.77
TMED1-201ENST00000214869 WDR62O43379 1518 aa26.12■■□□□ 1.77
TMED1-201ENST00000214869 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
TMED1-201ENST00000214869 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
TMED1-201ENST00000214869 EEA1Q15075 1411 aa26.07■■□□□ 1.76
TMED1-201ENST00000214869 SOGA1O94964 1423 aa26.04■■□□□ 1.76
TMED1-201ENST00000214869 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.96■■□□□ 1.75
TMED1-201ENST00000214869 WDR97A6NE52 1622 aa25.96■■□□□ 1.75
TMED1-201ENST00000214869 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.95■■□□□ 1.75
TMED1-201ENST00000214869 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
TMED1-201ENST00000214869 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.92■■□□□ 1.74
TMED1-201ENST00000214869 KIF27Q86VH2 1401 aa25.92■■□□□ 1.74
TMED1-201ENST00000214869 CUX2O14529 1486 aa25.91■■□□□ 1.74
TMED1-201ENST00000214869 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
TMED1-201ENST00000214869 IFT140Q96RY7 1462 aa25.85■■□□□ 1.73
TMED1-201ENST00000214869 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.84■■□□□ 1.73
TMED1-201ENST00000214869 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.8■■□□□ 1.72
TMED1-201ENST00000214869 KIF21BO75037 1637 aa25.75■■□□□ 1.71
TMED1-201ENST00000214869 IGF1RP08069 1367 aa25.72■■□□□ 1.71
TMED1-201ENST00000214869 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.69■■□□□ 1.7
TMED1-201ENST00000214869 PRXQ9BXM0 1461 aa25.69■■□□□ 1.7
TMED1-201ENST00000214869 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TMED1-201ENST00000214869 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.67■■□□□ 1.7
TMED1-201ENST00000214869 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.65■■□□□ 1.7
TMED1-201ENST00000214869 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.65■■□□□ 1.7
TMED1-201ENST00000214869 CUL7Q14999 1698 aa25.64■■□□□ 1.69
TMED1-201ENST00000214869 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
TMED1-201ENST00000214869 PBRM1Q86U86 1689 aa25.63■■□□□ 1.69
TMED1-201ENST00000214869 GOLGA3Q08378 1498 aa25.62■■□□□ 1.69
TMED1-201ENST00000214869 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TMED1-201ENST00000214869 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.59■■□□□ 1.69
TMED1-201ENST00000214869 GRIN2BQ13224 1484 aa25.57■■□□□ 1.68
TMED1-201ENST00000214869 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa25.55■■□□□ 1.68
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TMED1-201ENST00000214869 ADAMTS12P58397 1594 aa25.46■■□□□ 1.67
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TMED1-201ENST00000214869 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
TMED1-201ENST00000214869 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.39■■□□□ 1.65
TMED1-201ENST00000214869 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
TMED1-201ENST00000214869 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.37■■□□□ 1.65
TMED1-201ENST00000214869 SYNJ2O15056 1496 aa25.3■■□□□ 1.64
TMED1-201ENST00000214869 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa25.29■■□□□ 1.64
TMED1-201ENST00000214869 CEP162Q5TB80 1403 aa25.27■■□□□ 1.64
TMED1-201ENST00000214869 GRIN2AQ12879 1464 aa25.24■■□□□ 1.63
TMED1-201ENST00000214869 CLIP1P30622 1438 aa25.16■■□□□ 1.62
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