Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CHAF1AQ13111 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CHAF1AQ13111 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CHAF1AQ13111 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
CHAF1AQ13111 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CHAF1AQ13111 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CHAF1AQ13111 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CHAF1AQ13111 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CHAF1AQ13111 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
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