Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ACACAQ13085 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ACACAQ13085 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ACACAQ13085 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ACACAQ13085 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ACACAQ13085 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACACAQ13085 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACACAQ13085 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ACACAQ13085 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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