Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LMAN2Q12907 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LMAN2Q12907 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LMAN2Q12907 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMAN2Q12907 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMAN2Q12907 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMAN2Q12907 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMAN2Q12907 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
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