Protein–RNA interactions for Protein: Q12834

CDC20, Cell division cycle protein 20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC20Q12834 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC20Q12834 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC20Q12834 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC20Q12834 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDC20Q12834 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDC20Q12834 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDC20Q12834 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms