Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC48.02■■■■■ 5.28
HMGXB3Q12766 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC47.98■■■■■ 5.27
HMGXB3Q12766 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC47.97■■■■■ 5.27
HMGXB3Q12766 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
HMGXB3Q12766 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
HMGXB3Q12766 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC47.94■■■■■ 5.27
HMGXB3Q12766 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.94■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC47.93■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.89■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC47.88■■■■■ 5.26
HMGXB3Q12766 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC47.87■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC47.86■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC47.83■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.82■■■■■ 5.25
HMGXB3Q12766 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC47.81■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC47.8■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.8■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC47.79■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
HMGXB3Q12766 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
HMGXB3Q12766 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC47.74■■■■■ 5.23
HMGXB3Q12766 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC47.74■■■■■ 5.23
HMGXB3Q12766 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
HMGXB3Q12766 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
HMGXB3Q12766 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
HMGXB3Q12766 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.67■■■■■ 5.22
HMGXB3Q12766 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
HMGXB3Q12766 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.64■■■■■ 5.22
HMGXB3Q12766 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC47.62■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC47.62■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.61■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC47.58■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC47.58■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC47.57■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.57■■■■■ 5.21
HMGXB3Q12766 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC47.53■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.53■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC47.51■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
HMGXB3Q12766 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC47.5■■■■■ 5.19
HMGXB3Q12766 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
HMGXB3Q12766 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC47.47■■■■■ 5.19
HMGXB3Q12766 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
HMGXB3Q12766 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.45■■■■■ 5.19
HMGXB3Q12766 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC47.42■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC47.41■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC47.41■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC47.4■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC47.4■■■■■ 5.18
HMGXB3Q12766 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC47.35■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC47.32■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
HMGXB3Q12766 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC47.31■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC47.29■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC47.27■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.27■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
HMGXB3Q12766 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms