Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SYCNQ0VAF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SYCNQ0VAF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYCNQ0VAF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYCNQ0VAF6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms