Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CKAP4Q07065 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CKAP4Q07065 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CKAP4Q07065 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP4Q07065 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP4Q07065 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP4Q07065 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CKAP4Q07065 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKAP4Q07065 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKAP4Q07065 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CKAP4Q07065 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKAP4Q07065 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKAP4Q07065 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CKAP4Q07065 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP4Q07065 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP4Q07065 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP4Q07065 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP4Q07065 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CKAP4Q07065 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CKAP4Q07065 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CKAP4Q07065 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CKAP4Q07065 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CKAP4Q07065 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms