Protein–RNA interactions for Protein: Q02833

RASSF7, Ras association domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF7Q02833 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RASSF7Q02833 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.84■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
RASSF7Q02833 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RASSF7Q02833 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RASSF7Q02833 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
RASSF7Q02833 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
RASSF7Q02833 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RASSF7Q02833 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RASSF7Q02833 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
RASSF7Q02833 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms