Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ID3Q02535 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ID3Q02535 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ID3Q02535 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ID3Q02535 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ID3Q02535 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ID3Q02535 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ID3Q02535 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ID3Q02535 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ID3Q02535 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ID3Q02535 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ID3Q02535 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ID3Q02535 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ID3Q02535 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ID3Q02535 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ID3Q02535 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ID3Q02535 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ID3Q02535 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ID3Q02535 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ID3Q02535 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ID3Q02535 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ID3Q02535 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ID3Q02535 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ID3Q02535 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ID3Q02535 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ID3Q02535 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ID3Q02535 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ID3Q02535 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ID3Q02535 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ID3Q02535 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ID3Q02535 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ID3Q02535 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ID3Q02535 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ID3Q02535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ID3Q02535 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ID3Q02535 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ID3Q02535 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ID3Q02535 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ID3Q02535 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ID3Q02535 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ID3Q02535 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ID3Q02535 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ID3Q02535 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ID3Q02535 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ID3Q02535 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ID3Q02535 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ID3Q02535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ID3Q02535 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ID3Q02535 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ID3Q02535 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ID3Q02535 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ID3Q02535 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ID3Q02535 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ID3Q02535 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ID3Q02535 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ID3Q02535 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ID3Q02535 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ID3Q02535 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ID3Q02535 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ID3Q02535 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ID3Q02535 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ID3Q02535 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ID3Q02535 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ID3Q02535 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ID3Q02535 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ID3Q02535 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ID3Q02535 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ID3Q02535 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ID3Q02535 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ID3Q02535 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ID3Q02535 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ID3Q02535 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ID3Q02535 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ID3Q02535 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ID3Q02535 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ID3Q02535 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ID3Q02535 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ID3Q02535 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms