Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PITPNAQ00169 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PITPNAQ00169 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PITPNAQ00169 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PITPNAQ00169 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PITPNAQ00169 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PITPNAQ00169 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms