Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CXCL6P80162 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CXCL6P80162 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL6P80162 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL6P80162 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms