Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSNK2A1P68400 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSNK2A1P68400 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSNK2A1P68400 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CSNK2A1P68400 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CSNK2A1P68400 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CSNK2A1P68400 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 170.3 ms