Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKP1P63208 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SKP1P63208 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SKP1P63208 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
SKP1P63208 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKP1P63208 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SKP1P63208 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SKP1P63208 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKP1P63208 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKP1P63208 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SKP1P63208 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SKP1P63208 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKP1P63208 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SKP1P63208 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKP1P63208 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SKP1P63208 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKP1P63208 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKP1P63208 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SKP1P63208 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SKP1P63208 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKP1P63208 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKP1P63208 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKP1P63208 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SKP1P63208 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SKP1P63208 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKP1P63208 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SKP1P63208 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SKP1P63208 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKP1P63208 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SKP1P63208 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SKP1P63208 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKP1P63208 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKP1P63208 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKP1P63208 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKP1P63208 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKP1P63208 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SKP1P63208 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKP1P63208 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKP1P63208 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKP1P63208 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKP1P63208 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKP1P63208 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SKP1P63208 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKP1P63208 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKP1P63208 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SKP1P63208 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SKP1P63208 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKP1P63208 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SKP1P63208 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SKP1P63208 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SKP1P63208 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKP1P63208 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKP1P63208 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKP1P63208 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SKP1P63208 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKP1P63208 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SKP1P63208 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKP1P63208 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKP1P63208 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SKP1P63208 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKP1P63208 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKP1P63208 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKP1P63208 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKP1P63208 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SKP1P63208 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKP1P63208 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SKP1P63208 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SKP1P63208 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SKP1P63208 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKP1P63208 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SKP1P63208 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKP1P63208 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SKP1P63208 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKP1P63208 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKP1P63208 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKP1P63208 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SKP1P63208 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKP1P63208 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKP1P63208 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKP1P63208 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKP1P63208 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SKP1P63208 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKP1P63208 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKP1P63208 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SKP1P63208 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SKP1P63208 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SKP1P63208 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SKP1P63208 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKP1P63208 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKP1P63208 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKP1P63208 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKP1P63208 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SKP1P63208 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SKP1P63208 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms