Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HERVK_113P63121 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HERVK_113P63121 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
HERVK_113P63121 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HERVK_113P63121 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERVK_113P63121 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms