Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP46P62068 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP46P62068 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP46P62068 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP46P62068 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP46P62068 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP46P62068 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP46P62068 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP46P62068 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP46P62068 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP46P62068 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
USP46P62068 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP46P62068 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP46P62068 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
USP46P62068 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP46P62068 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP46P62068 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP46P62068 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
USP46P62068 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
USP46P62068 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP46P62068 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
USP46P62068 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP46P62068 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
USP46P62068 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP46P62068 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP46P62068 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP46P62068 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP46P62068 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP46P62068 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP46P62068 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP46P62068 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP46P62068 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
USP46P62068 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP46P62068 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP46P62068 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP46P62068 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
USP46P62068 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP46P62068 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP46P62068 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP46P62068 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP46P62068 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP46P62068 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP46P62068 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP46P62068 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP46P62068 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP46P62068 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP46P62068 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP46P62068 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP46P62068 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP46P62068 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP46P62068 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP46P62068 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP46P62068 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP46P62068 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP46P62068 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
USP46P62068 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
USP46P62068 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP46P62068 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP46P62068 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP46P62068 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP46P62068 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP46P62068 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP46P62068 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP46P62068 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP46P62068 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP46P62068 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP46P62068 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP46P62068 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP46P62068 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP46P62068 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP46P62068 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP46P62068 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
USP46P62068 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP46P62068 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
USP46P62068 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP46P62068 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP46P62068 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP46P62068 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP46P62068 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
USP46P62068 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP46P62068 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP46P62068 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
USP46P62068 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
USP46P62068 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
USP46P62068 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP46P62068 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
USP46P62068 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
USP46P62068 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP46P62068 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP46P62068 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
USP46P62068 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP46P62068 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP46P62068 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
USP46P62068 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms