Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ERVFC1-1P60608 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ERVFC1-1P60608 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERVFC1-1P60608 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVFC1-1P60608 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERVFC1-1P60608 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.3 ms