Protein–RNA interactions for Protein: P60602

ROMO1, Reactive oxygen species modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROMO1P60602 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ROMO1P60602 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
ROMO1P60602 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ROMO1P60602 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms