Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCBP4P57723 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCBP4P57723 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCBP4P57723 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PCBP4P57723 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PCBP4P57723 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCBP4P57723 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms