Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RIPPLY3P57055 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RIPPLY3P57055 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RIPPLY3P57055 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RIPPLY3P57055 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RIPPLY3P57055 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RIPPLY3P57055 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RIPPLY3P57055 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms