Protein–RNA interactions for Protein: P52799

EFNB2, Ephrin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB2P52799 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNB2P52799 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNB2P52799 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EFNB2P52799 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EFNB2P52799 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EFNB2P52799 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EFNB2P52799 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms