Protein–RNA interactions for Protein: P50336

PPOX, Protoporphyrinogen oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPOXP50336 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPOXP50336 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PPOXP50336 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPOXP50336 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPOXP50336 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPOXP50336 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPOXP50336 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPOXP50336 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PPOXP50336 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPOXP50336 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPOXP50336 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPOXP50336 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPOXP50336 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PPOXP50336 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPOXP50336 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PPOXP50336 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPOXP50336 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPOXP50336 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPOXP50336 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPOXP50336 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PPOXP50336 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPOXP50336 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPOXP50336 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPOXP50336 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PPOXP50336 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPOXP50336 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PPOXP50336 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PPOXP50336 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPOXP50336 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPOXP50336 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPOXP50336 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPOXP50336 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PPOXP50336 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PPOXP50336 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PPOXP50336 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPOXP50336 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPOXP50336 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPOXP50336 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPOXP50336 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPOXP50336 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPOXP50336 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPOXP50336 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPOXP50336 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPOXP50336 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPOXP50336 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPOXP50336 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPOXP50336 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPOXP50336 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPOXP50336 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPOXP50336 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPOXP50336 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPOXP50336 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPOXP50336 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPOXP50336 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPOXP50336 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPOXP50336 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPOXP50336 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPOXP50336 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPOXP50336 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPOXP50336 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPOXP50336 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPOXP50336 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPOXP50336 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPOXP50336 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPOXP50336 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPOXP50336 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPOXP50336 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPOXP50336 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPOXP50336 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPOXP50336 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPOXP50336 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPOXP50336 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPOXP50336 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPOXP50336 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPOXP50336 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPOXP50336 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PPOXP50336 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PPOXP50336 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PPOXP50336 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPOXP50336 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PPOXP50336 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPOXP50336 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPOXP50336 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PPOXP50336 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPOXP50336 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PPOXP50336 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPOXP50336 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPOXP50336 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPOXP50336 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPOXP50336 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPOXP50336 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PPOXP50336 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PPOXP50336 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms