Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
PRIM1P49642 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PRIM1P49642 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PRIM1P49642 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PRIM1P49642 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PRIM1P49642 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRIM1P49642 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PRIM1P49642 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRIM1P49642 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms