Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TGM4P49221 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGM4P49221 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TGM4P49221 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM4P49221 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TGM4P49221 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGM4P49221 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TGM4P49221 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TGM4P49221 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM4P49221 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM4P49221 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TGM4P49221 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGM4P49221 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TGM4P49221 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TGM4P49221 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGM4P49221 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGM4P49221 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM4P49221 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM4P49221 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM4P49221 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGM4P49221 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGM4P49221 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM4P49221 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGM4P49221 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGM4P49221 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGM4P49221 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGM4P49221 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM4P49221 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM4P49221 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM4P49221 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM4P49221 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGM4P49221 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM4P49221 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TGM4P49221 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TGM4P49221 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM4P49221 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM4P49221 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM4P49221 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM4P49221 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM4P49221 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TGM4P49221 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM4P49221 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TGM4P49221 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGM4P49221 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGM4P49221 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TGM4P49221 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM4P49221 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM4P49221 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM4P49221 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM4P49221 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TGM4P49221 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM4P49221 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM4P49221 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM4P49221 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TGM4P49221 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM4P49221 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM4P49221 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TGM4P49221 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM4P49221 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM4P49221 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TGM4P49221 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TGM4P49221 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM4P49221 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM4P49221 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM4P49221 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM4P49221 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM4P49221 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TGM4P49221 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TGM4P49221 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM4P49221 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM4P49221 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM4P49221 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM4P49221 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TGM4P49221 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM4P49221 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM4P49221 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM4P49221 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TGM4P49221 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM4P49221 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM4P49221 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM4P49221 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM4P49221 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TGM4P49221 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM4P49221 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM4P49221 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM4P49221 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TGM4P49221 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TGM4P49221 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms