Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NMUP48645 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMUP48645 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
NMUP48645 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMUP48645 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMUP48645 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMUP48645 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMUP48645 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMUP48645 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NMUP48645 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMUP48645 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMUP48645 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMUP48645 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NMUP48645 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMUP48645 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NMUP48645 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMUP48645 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMUP48645 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMUP48645 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NMUP48645 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMUP48645 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMUP48645 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NMUP48645 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMUP48645 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
NMUP48645 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMUP48645 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMUP48645 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMUP48645 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMUP48645 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMUP48645 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NMUP48645 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMUP48645 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMUP48645 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMUP48645 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMUP48645 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMUP48645 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NMUP48645 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMUP48645 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMUP48645 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NMUP48645 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMUP48645 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMUP48645 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NMUP48645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMUP48645 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NMUP48645 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMUP48645 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMUP48645 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMUP48645 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMUP48645 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
NMUP48645 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
NMUP48645 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMUP48645 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMUP48645 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NMUP48645 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMUP48645 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMUP48645 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMUP48645 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NMUP48645 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMUP48645 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NMUP48645 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMUP48645 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMUP48645 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NMUP48645 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMUP48645 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NMUP48645 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NMUP48645 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMUP48645 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NMUP48645 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMUP48645 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMUP48645 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMUP48645 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMUP48645 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMUP48645 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NMUP48645 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMUP48645 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMUP48645 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMUP48645 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMUP48645 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NMUP48645 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMUP48645 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMUP48645 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMUP48645 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NMUP48645 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMUP48645 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NMUP48645 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMUP48645 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NMUP48645 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMUP48645 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMUP48645 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NMUP48645 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMUP48645 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMUP48645 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NMUP48645 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms