Protein–RNA interactions for Protein: P45452

MMP13, Collagenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP13P45452 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP13P45452 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP13P45452 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP13P45452 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP13P45452 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP13P45452 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP13P45452 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP13P45452 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP13P45452 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP13P45452 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP13P45452 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP13P45452 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP13P45452 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP13P45452 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP13P45452 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP13P45452 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP13P45452 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP13P45452 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP13P45452 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP13P45452 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP13P45452 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP13P45452 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP13P45452 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP13P45452 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP13P45452 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP13P45452 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP13P45452 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP13P45452 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP13P45452 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP13P45452 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP13P45452 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP13P45452 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP13P45452 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP13P45452 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP13P45452 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP13P45452 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP13P45452 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP13P45452 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP13P45452 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP13P45452 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP13P45452 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP13P45452 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP13P45452 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP13P45452 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP13P45452 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP13P45452 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP13P45452 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP13P45452 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP13P45452 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP13P45452 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP13P45452 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP13P45452 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP13P45452 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP13P45452 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP13P45452 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP13P45452 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP13P45452 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP13P45452 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP13P45452 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP13P45452 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP13P45452 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP13P45452 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP13P45452 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP13P45452 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP13P45452 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP13P45452 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP13P45452 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP13P45452 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP13P45452 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP13P45452 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP13P45452 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP13P45452 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP13P45452 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP13P45452 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP13P45452 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP13P45452 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP13P45452 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP13P45452 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP13P45452 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP13P45452 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP13P45452 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MMP13P45452 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP13P45452 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP13P45452 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP13P45452 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MMP13P45452 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP13P45452 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MMP13P45452 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms