Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MCAMP43121 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
MCAMP43121 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
MCAMP43121 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MCAMP43121 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MCAMP43121 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MCAMP43121 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
MCAMP43121 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
MCAMP43121 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MCAMP43121 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
MCAMP43121 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
MCAMP43121 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCAMP43121 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCAMP43121 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MCAMP43121 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
MCAMP43121 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCAMP43121 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCAMP43121 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
MCAMP43121 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MCAMP43121 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCAMP43121 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
MCAMP43121 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
MCAMP43121 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
MCAMP43121 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MCAMP43121 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
MCAMP43121 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
MCAMP43121 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
MCAMP43121 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MCAMP43121 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
MCAMP43121 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
MCAMP43121 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
MCAMP43121 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
MCAMP43121 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCAMP43121 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCAMP43121 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCAMP43121 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
MCAMP43121 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MCAMP43121 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
MCAMP43121 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
MCAMP43121 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCAMP43121 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCAMP43121 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
MCAMP43121 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
MCAMP43121 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
MCAMP43121 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
MCAMP43121 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCAMP43121 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCAMP43121 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCAMP43121 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
MCAMP43121 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MCAMP43121 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
MCAMP43121 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
MCAMP43121 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
MCAMP43121 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCAMP43121 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCAMP43121 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
MCAMP43121 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MCAMP43121 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
MCAMP43121 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
MCAMP43121 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
MCAMP43121 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
MCAMP43121 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCAMP43121 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCAMP43121 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCAMP43121 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCAMP43121 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
MCAMP43121 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCAMP43121 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
MCAMP43121 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
MCAMP43121 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
MCAMP43121 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
MCAMP43121 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCAMP43121 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCAMP43121 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
MCAMP43121 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.69
MCAMP43121 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MCAMP43121 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
MCAMP43121 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
MCAMP43121 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
MCAMP43121 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
MCAMP43121 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MCAMP43121 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
MCAMP43121 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MCAMP43121 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
MCAMP43121 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
MCAMP43121 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
MCAMP43121 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCAMP43121 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
MCAMP43121 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
MCAMP43121 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCAMP43121 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCAMP43121 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCAMP43121 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
MCAMP43121 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MCAMP43121 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
MCAMP43121 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.73■■■□□ 2.67
MCAMP43121 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCAMP43121 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCAMP43121 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
MCAMP43121 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms