Protein–RNA interactions for Protein: P41732

TSPAN7, Tetraspanin-7, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN7P41732 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN7P41732 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN7P41732 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TSPAN7P41732 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TSPAN7P41732 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TSPAN7P41732 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TSPAN7P41732 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms