Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PBX2P40425 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBX2P40425 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBX2P40425 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBX2P40425 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PBX2P40425 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBX2P40425 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PBX2P40425 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBX2P40425 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBX2P40425 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBX2P40425 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBX2P40425 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBX2P40425 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PBX2P40425 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PBX2P40425 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PBX2P40425 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PBX2P40425 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PBX2P40425 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PBX2P40425 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PBX2P40425 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PBX2P40425 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PBX2P40425 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PBX2P40425 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PBX2P40425 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PBX2P40425 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PBX2P40425 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PBX2P40425 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PBX2P40425 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PBX2P40425 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PBX2P40425 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PBX2P40425 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PBX2P40425 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PBX2P40425 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PBX2P40425 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PBX2P40425 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PBX2P40425 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PBX2P40425 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PBX2P40425 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PBX2P40425 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PBX2P40425 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PBX2P40425 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PBX2P40425 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PBX2P40425 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PBX2P40425 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PBX2P40425 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PBX2P40425 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX2P40425 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX2P40425 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX2P40425 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX2P40425 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PBX2P40425 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PBX2P40425 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PBX2P40425 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PBX2P40425 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PBX2P40425 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PBX2P40425 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PBX2P40425 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PBX2P40425 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PBX2P40425 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PBX2P40425 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PBX2P40425 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PBX2P40425 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PBX2P40425 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PBX2P40425 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBX2P40425 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PBX2P40425 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBX2P40425 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PBX2P40425 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBX2P40425 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PBX2P40425 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBX2P40425 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PBX2P40425 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PBX2P40425 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBX2P40425 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PBX2P40425 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PBX2P40425 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PBX2P40425 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PBX2P40425 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PBX2P40425 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PBX2P40425 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PBX2P40425 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PBX2P40425 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PBX2P40425 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PBX2P40425 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PBX2P40425 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PBX2P40425 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PBX2P40425 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PBX2P40425 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX2P40425 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PBX2P40425 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBX2P40425 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PBX2P40425 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBX2P40425 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBX2P40425 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PBX2P40425 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX2P40425 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX2P40425 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX2P40425 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX2P40425 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PBX2P40425 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms