Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ITGAEP38570 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ITGAEP38570 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
ITGAEP38570 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ITGAEP38570 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ITGAEP38570 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC40.04■■■■■ 4
ITGAEP38570 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
ITGAEP38570 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ITGAEP38570 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ITGAEP38570 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
ITGAEP38570 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.03■■■■■ 4
ITGAEP38570 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ITGAEP38570 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
ITGAEP38570 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.01■■■■■ 4
ITGAEP38570 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ITGAEP38570 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.95■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ITGAEP38570 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.92■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC39.9■■■■□ 3.98
ITGAEP38570 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC39.85■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ITGAEP38570 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
ITGAEP38570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC39.74■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
ITGAEP38570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.94
ITGAEP38570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.63■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC39.62■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC39.58■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
ITGAEP38570 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.92
ITGAEP38570 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
ITGAEP38570 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC39.55■■■■□ 3.92
ITGAEP38570 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
ITGAEP38570 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ITGAEP38570 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
ITGAEP38570 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ITGAEP38570 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms